Nagato byÂł sierotÂą, ktĂłra brnĂŞÂła przez Âżycie podczas wojny.Nagato po raz pierwszy aktywowaÂł Rinnegan'a gdy podczas wojny shinobi z Konohy wtargnĂŞli do jego domu i zabili mu rodzicĂłw. Po Âśmierci rodzicĂłw wyruszyÂł w podró¿ aby szukaĂŚ lepszego Âżycia. Podczas podró¿y Nagato spotkaÂł psa ktĂłrego przygarn¹³. Gdy podczas podró¿y zemdlaÂł uratowaÂła go Konan dajÂąc mu kawaÂłek chleba i sprowadzajÂąc go do miejsca gdzie wraz z Yahiko mieszkali. Tam przyszÂły czÂłonek Akatsuki usÂłyszaÂł marzenie Yahiko, czyli marzenie o pokoju na Âświecie zadajÂąc bĂłl innym ludziom taki bĂłl jaki on czuÂł. Podczas jednej z prĂłb zdobycia jedzenia z nieznanego miejsca wyleciaÂł kunaia z wybuchowÂą notkÂą ktĂłry powaÂżnie raniÂł psa Nagato. PóŸniej jak siĂŞ okazuje byÂło to miejsce walki Hanzou z Trzema Sanninami z Konohy. Po tym wydarzeniu Nagato wraz z przyjació³mi spotyka TrĂłjkĂŞ SanninĂłw, a ich mistrzem zostaje Jiraiya . PostanowiÂł on nauczyĂŚ ich tajnikĂłw walki oraz technik ninjutsu. Nauki Jiraiyi zakoĂączyÂły siĂŞ sukcesem i najlepszym spoÂśrĂłd uczniĂłw okazaÂł siĂŞ wÂłaÂśnie Nagato. Niewiarygodne byÂło to, Âże opanowaÂł techniki wszystkich piĂŞciu istniejÂących Âżywio³ów w Âświecie ninja. ByĂŚ moÂże w wynikach treningu pomagaÂła mu jego determinacja i chĂŞĂŚ obrony przyjació³.  Kilka lat póŸniej kiedy caÂła trĂłjka sÂą doroÂśli nale¿¹ do specjalnej grupy ktĂłrÂą kierowaÂł Yahiko. Hanzou czujÂąc zagroÂżenie w druÂżynie Yahiko postanawia zawrzeĂŚ przymierze jednak okazuje siĂŞ to byĂŚ kÂłamstwem. Hanzou wraz ze swojÂą armiÂą byÂł wspierany przez Danzou i jego KorzeĂą. Podczas walki Hanzou wzi¹³ Konan jako zakÂładniczkĂŞ i ¿¹daÂł od Nagato aby ten zabiÂł Yahiko albo on zabije Konan. Yahiko nie chcÂąc aby jeko przyjació³ka zginĂŞÂła prosi Nagato aby ten zrobiÂł to co mĂłwi Hanzou. Nagato jednak siĂŞ nie zgadza ale Yahiko go nie sÂłucha i nadziewa siĂŞ na kunai Nagato. Hanzou mimo tego i tak chciaÂł zabiĂŚ Konan i Nagato ale wtedy Nagato uaktywnia moce Rinnegan'a i ratuje Konan z rÂąk Hanzou samemu lÂądujÂąc na wybuchowych notkach ale nawet to nie przeszkadza Nagato i pokonuje wszystkich ninja z bandy Hanzou i Danzou robiÂąc technikĂŞ Kuchiyose Gedou Mazou, ktĂłra bardzo szybko wyrywaÂła dusze przeciwnikĂłw. Danzou uciekÂł z pola walki a Hanzou zostaÂł zabity owÂą technikÂą. Po tym zdarzeniu Nagato przekreÂśla opaskĂŞ i postanawia zostaĂŚ nukeninem ktĂłry bĂŞdzie d¹¿yÂł marzeniem Yahiko. . . . .  . Nagato zawsze pragn¹³ nieustajÂącego pokoju i zgody na caÂłym Âświecie. Po tych zdarzeniach Jiraiya uznaÂł, Âże dzieci sÂą juÂż na doœÌ dobrym poziomie aby samemu obroniĂŚ siĂŞ przed niebezpieczeĂąstwem i wyruszyÂł w dalszÂą podró¿. Od tego czasu nie byÂło nic wiadomo o mÂłodym posiadaczu rinnengana i jego przyjacioÂłach. Dopiero gdy Jiraiya odkryÂł toÂżsamoœÌ z pozoru przywĂłdcy Akatsuki zaczĂŞÂło siĂŞ coÂś dziaĂŚ. Sannin spotkaÂł siĂŞ na polu bitwy ze swoim dawnym uczniem. Dziwnym przypadkiem osoba ta posiadaÂła oczy rinnengan, lecz w ogĂłle nie przypominaÂła Nagato. Po dÂłuÂższym starciu Jiraiya zostaÂł zmuszony do przejÂścia w "tryb pustelniczy" i zwoÂłania dwĂłch najsilniejszych i najmÂądrzejszych pustelnikĂłw. Ku zdumieniu sannina przeciwnik stosowaÂł tylko ró¿nego rodzaju jutsu przywoÂłania, ale zaraz po przejÂściu Jiraiyi w silniejszÂą formĂŞ zwoÂłaÂł dwĂłch ludzi, ktĂłrzy takÂże posiadali wspaniaÂłe oczy. PotĂŞÂżne ataki trzech pustelnikĂłw nie zdziaÂłaÂły nic na ciaÂła z rinnenganami. Jedno z nich miaÂło moc pochÂłaniania kaÂżdego ninjutsu, a wszystkie byÂły doœÌ odporne na taijutsu. Sannin po porozumieniu siĂŞ z dwoma pustelnikami dokonaÂł chwilowego odwrotu. UciekajÂąc uÂświadomiÂł sobie iÂż caÂła trĂłjka przeciwnikĂłw moÂże w kaÂżdej chwili zobaczyĂŚ ten sam obraz. Z tÂą umiejĂŞtnoÂściÂą tylko jeden z nich moÂże obserwowaĂŚ JiraiyĂŞ a pozostaÂła dwĂłjka juÂż przygotowuje siĂŞ do ataku. Sannin obmyÂśliÂł takÂą strategiĂŞ, Âże tyko jeden mĂłgÂł na niego patrzeĂŚ. W ten sposĂłb ciaÂło przeciwnika ulegÂło potĂŞÂżnemu genjutsu wywoÂłanemu przez dwĂłch Âżabich pustelnikĂłw siedzÂących na ramieniu mĂŞdrca. Tym sposobem Jiraiya zniszczyÂł obezwÂładnione ciaÂła i wydawaÂło siĂŞ, Âże to juÂż koniec walki. Uspokojony sannin oberwaÂł mocno od nieznanego przeciwnika, ktĂłry nagle wyskoczyÂł na niego z tyÂłu. MĂŞdrzec straciÂł przy tym jednÂą rĂŞkĂŞ, a jego oczom ukazaÂła siĂŞ szĂłstka ludzi w pÂłaszczach akatsuki posiadajÂących potĂŞÂżne oczy. Przedstawili siĂŞ oni jako "Pain". Zrozpaczony Jiraiya nie wiedziaÂł juÂż o co chodzi. SzeÂściu ninja zaatakowaÂło sannina, a ten ukryÂł siĂŞ w Âżo³¹dku Âżaby razem z jednym Painem. PokonaÂł go sam na sam i gdy tajemniczemu ninjy zsunĂŞÂła siĂŞ opaska z czoÂła mĂŞdrzec doznaÂł olÂśnienia. PrzypomniaÂł sobie iÂż toczyÂł walkĂŞ kiedyÂś z owym le¿¹cym shinobim. MogÂąc siĂŞ wycofaĂŚ dokonaÂł trudnego wyboru tak jak to kiedyÂś przepowiedziaÂł mu najstarszy Âżabi mĂŞdrzec. Jiraiya ponownie stan¹³ naprzeciw Paina i skojarzyÂł, Âże walczyÂł juÂż kiedyÂś z kaÂżdym z ciaÂł. Najbardziej w oko wpadÂło mu jedno z nich, ktĂłre przypominaÂło mu Yachiko. MĂŞdrzec miaÂł racjĂŞ, poniewaÂż Nagato przeznaczyÂł sobie ciaÂło dawnego kolegi dla jego wÂłasnego uÂżytku. Pain przebiÂł mĂŞdrcowi gardÂło, a ten znalazÂł siĂŞ w kÂłopotliwej sytuacji, poniewaÂż nie miaÂł jak przekazaĂŚ informacji kim naprawdĂŞ jest osoba stajÂąca naprzeciw niego. SamÂą wolÂą przywrĂłciÂł  siebie do Âżycia i wypaliÂł zaszyfrowanÂą wiadomoœÌ na plecach Âżabiego pustelnika. Tak zakoĂączyÂł siĂŞ Âżywot wspaniaÂłego Jiraiyi, poniewaÂż po chwili Pain wrzuciÂł go w wodne otchÂłanie. W wiosce odszyfrowano wiadomoœÌ i okazaÂła siĂŞ ona brzmieĂŚ "ten prawdziwy nie jest z nimi". Po wyczerpujÂącej bitwie szĂłstka shinobi (ciaÂło  Chikushodo zostaÂło zniszczone, lecz Pain zastÂąpiÂł je innym) udaÂła siĂŞ po jinchuuriki z Konohy-Naruto Uzumakiego. Pain potĂŞÂżnym jutsu zniszczyÂł dosÂłownie ca³¹ powierzchniĂŞ wioski. Tsunade poÂświĂŞciÂła siĂŞ i ochroniÂła wszystkich mieszkaĂącĂłw Konohy. PotĂŞÂżny czÂłonek akatsuki zabiÂł Hatake Kakashiego oraz wielu innych ninja. Po przebytym treningu z jednym z dwĂłjki najmÂądrzejszych pustelnikĂłw o wiele silniejszy Naruto powrĂłciÂł aby stan¹Ì oko w oko z potĂŞÂżnym Painem. W walce ukazaÂły siĂŞ umiĂŞjĂŞtnoÂści wszystkich ciaÂł. Naruto udaÂło siĂŞ odkryĂŚ prawdziwÂą toÂżsamoœÌ Paina. Ten prawdziwy Nagato znajdujÂąc siĂŞ w papierowym drzewie zrobionym przez Konan kontrolowaÂł swoje "marionetki" z odlegÂłoÂści. Uzumaki odbyÂł rozmowĂŞ z ledwo ÂżyjÂącym Painem i uÂświadomiÂł mu czym naprawdĂŞ jest dobro i pokĂłj oraz jak do tego d¹¿yĂŚ. Ostatecznie Nagato ktĂłry wreszcie zrozumiaÂł, Âże to co robiÂł byÂło zÂłe swoim specjalnym jutsu wskrzesiÂł do Âżycia wszystkich ktĂłrych zabiÂł, a min. Kakashiego i Âżabiego pustelnika. Tak oto zakoĂączyÂł siĂŞ Âżywot Paina (Nagato). W Âżyciu zawsze pragn¹³ pokoju, ale w zwiÂązku z przeÂżyciami z wojny pojmowaÂł to zupeÂłnie inaczej. Zacz¹³ uwaÂżaĂŚ, Âże Âświat i wszyscy ludzie muszÂą poznaĂŚ prawdziwy bĂłl. Zgodnie z jego twierdzeniem dopiero wtedy nadszedÂłby pokĂłj.